.. _参数说明: ************************************ 参数说明 ************************************ .. _ 参数列表: ============================================================================== parameter参数列表 ============================================================================== -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - task_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - sys.pseudoType_ - sys.pseudoPath_ - sys.structure_ - sys.symmetry_ - sys.symmetryAccuracy_ - sys.functional_ - sys.spin_ - sys.soi_ - sys.electron_ - sys.hybrid_ - sys.hybridType_ - sys.hybridAlpha_ - sys.hybridOmega_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - cal.iniCharge_ - cal.iniWave_ - cal.cutoffFactor_ - cal.cutoff_ - cal.methods_ - cal.smearing_ - cal.sigma_ - cal.kpoints_ - cal.ksamping_ - cal.toalBands_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - io.charge_ - io.elf_ - io.potential_ - io.wave_ - io.band_ - io.dos_ - io.optical_ - io.bader_ - io.polarization_ - io.magProject_ - io.outStep_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - scf.max_ - scf.min_ - scf.mixBeta_ - scf.mixType_ - scf.convergence_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - relax.max_ - relax.freedom_ - relax.methods_ - relax.convergenceType_ - relax.convergence_ - relax.stepRange_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - dos.range_ - dos.resolution_ - dos.project_ - dos.EfShift_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - band.kpointsLabel_ - band.kpointsCoord_ - band.kpointsNumber_ - band.project_ - band.unfolding_ - band.primitiveUVW_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - potential.type_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - corr.chargedSystem_ - corr.dipol_ - corr.dipolDirection_ - corr.dftu_ - corr.dftuElements_ - corr.dftuOrbital_ - corr.dftuU_ - corr.dftuJ_ - corr.VDW_ - corr.VDWType_ - corr.dipolEfield_ - corr.dipolPosition_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - pcharge.bandIndex_ - pcharge.kpointsIndex_ - pcharge.sumK_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - neb.springK_ - neb.images_ - neb.iniFin_ - neb.method_ - neb.convergenceType_ - neb.convergence_ - neb.stepRange_ - neb.max_ - neb.freedom_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - frequency.dispOrder_ - frequency.dispRange_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - phonon.structureSize_ - phonon.method_ - phonon.type_ - phonon.isDisplacement_ - phonon.fdDisplacement_ - phonon.iniPhonon_ - phonon.qsamping_ - phonon.qpoints_ - phonon.qpointsLabel_ - phonon.qpointsCoord_ - phonon.qpointsNumber_ - phonon.primitiveUVW_ - phonon.dosRange_ - phonon.dosResolution_ - phonon.dosSigma_ - phonon.dfptEpsilon_ - phonon.nac_ - phonon.thermal_ - phonon.thermalRange_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - elastic.dispOrder_ - elastic.dispRange_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - aimd.ensemble_ - aimd.thermostat_ - aimd.iniTemp_ - aimd.finTemp_ - aimd.timeStep_ - aimd.totalSteps_ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _ 参数详细描述: ============================================================================== detail参数详细描述 ============================================================================== -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _task: **参数名称:** :guilabel:`task` **默认值:** 无 **可选值:** ``scf/relax/dos/band/potential/elf/pcharge/neb/frequency/phonon/elastic/aimd/epsilon/`` **描述:** :guilabel:`task` 参数表示计算的类型,必须设置; ``scf/relax`` 可以是从头计算(不需要设置 ``cal.iniCharge`` 和 ``cal.iniWave`` )也可以导入电荷密度或波函数(设置 ``cal.iniCharge`` 和 ``cal.iniWave`` ); ``dos/band/potential/elf`` 为后处理计算,必须要读取电荷密度,在导入电荷密度的同时可选择性的导入波函数(必须设置 **cal.iniCharge** ,选择性设置 **cal.iniWave** ); 当 **task=scf/realx** 时,默认输出 ``system.json`` ;当 **task=dos/band/potential/elf/pcharge** 时,默认输出对应的json文件 ``dos.json/band.json/potential.json/elf.json/pcharge.json`` ; **task=neb/frequency/phonon/elastic/aimd/epsilon** 分别对应过渡态/频率/声子/弹性/分子动力学/介电常数计算,默认输出对应的json文件 ``neb.json/frequency.json/phonon.json/elastic.json/aimd.json/epsilon.json``; **案例:** task = scf -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.pseudoType: **参数名称:** :guilabel:`sys.pseudoType` **默认值:** -1 **可选值:** -1/10/11 **描述:** ``sys.pseudoType`` 参数为设置 **DS-PAW** 计算所需的赝势格式;-1表示使用hzw赝势(*.paw),目前DS-PAW支持 **H He Li Be B C N O F Ne Na Mg Al Si P S Cl Ar K Ca Sc Ti V Cr Mn Fe Co Ni Cu Zn Ga Ge As Se Br Kr Rb Sr Y Zr Nb Mo Tc Ru Rh Pd Ag Cd In Sn Sb Te I Xe Cs Ba La Hf Ta W Re Os Ir Pt Au Hg Tl Pb Bi Po At Rn** 72种元素的hzw赝势; 10表示外部potcar格式赝势(*.potcar), 11表示外部pawpsp格式赝势(*.pawpsp); **案例:** sys.pseudoType = -1 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.pseudoPath: **参数名称:** :guilabel:`sys.pseudoPath` **默认值:** 当 ``sys.pseudoType`` =-1时,无需设置该参数,程序只能从安装路径 **/pseudopotential** 读取赝势文件 ;``sys.pseudoType`` = 10,默认值 **./** ;``sys.pseudoType`` = 11,默认值 **./** ; **描述:** ``sys.pseudoPath`` 参数为设置 **DS-PAW** 计算所需的赝势所在路径;一般无需自行设置,读取hzw赝势时会从默认存储路径读取,读取外部赝势时会默认从当前路径读取; **案例:** sys.pseudoPath = ./ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.structure: **参数名称:** :guilabel:`sys.structure` **默认值:** atoms.as **可选值:** XXX.as /XXX.json **描述:** ``sys.structure`` 参数设置结构文件的路径,结构文件可以是.as格式或.json格式,支持绝对路径和相对路径;使用DS-PAW进行结构弛豫之后会生成 ``relax.json`` 文件,可以直接设置sys.structure为 **relax.json** 即可读取结构弛豫的文件进行计算; **案例:** sys.structure = structure.as -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.symmetry: **参数名称:** :guilabel:`sys.symmetry` **默认值:** true **可选值:** true/false **描述:** ``sys.symmetry`` 该参数表示DS-PAW计算时是否进行对称性分析; **案例:** sys.symmetry = false -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.symmetryAccuracy: **参数名称:** :guilabel:`sys.symmetryAccuracy` **默认值:** 1.0e-5 **可选值:** real **描述:** ``sys.symmetryAccuracy`` 该参数表示DS-PAW计算时对称性分析的精度; **案例:** sys.symmetryAccuracy = 1.0e-6 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.functional: **参数名称:** :guilabel:`sys.functional` **默认值:** LDA **可选值:** LDA/PBE/REVPBE/RPBE/PBESOL/vdw-optPBE/vdw-optB88/vdw-optB86b/vdw-DF/vdw-revPBE/vdw-DF2/vdw-revDF2 **描述:** ``sys.functional`` 参数指定DS-PAW的泛函类型,如果 **sys.functional=LDA** 则会去读取指定路径下的LDA赝势;vdw开头的系列赝势对应泛函类的范德瓦尔斯校正方法; **案例:** sys.functional = PBESOL -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.spin: **参数名称:** :guilabel:`sys.spin` **默认值:** none **可选值:** none/collinear/non-collinear **描述:** ``sys.spin`` 参数指定计算的自旋性质; **none** 表示没有自旋, **collinear** 表示共线自旋, **non-collinear** 表示一般自旋; **案例:** sys.spin = collinear -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.soi: **参数名称:** :guilabel:`sys.soi` **默认值:** false **可选值:** true/false **描述:** ``sys.soi`` 表示是否考虑自旋轨道耦合效应;自旋轨道耦合效应需要在sys.spin=non-collinear时才会生效; **案例:** sys.soi = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.electron: **参数名称:** :guilabel:`sys.electron` **默认值:** 所有价电子的总和 **可选值:** real **描述:** ``sys.electron`` 参数指定价电子的总数;DS-PAW通过引入背景电荷的方法计算带电体系; **案例:** sys.electron = 12 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.hybrid: **参数名称:** :guilabel:`sys.hybrid` **默认值:** false **可选值:** true/false **描述:** ``sys.hybrid`` 参数指定是否使用杂化泛函;true表示引入杂化泛函,false表示不引入杂化泛函; **案例:** sys.hybrid = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.hybridType: **参数名称:** :guilabel:`sys.hybridType` **默认值:** HSE06 **可选值:** PBE0/HSE03/HSE06/B3LYP **描述:** ``sys.hybridType`` 参数指定杂化泛函的类型;该参数只有在sys.hybrid = true时生效; **案例:** sys.hybridType = HSE06 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.hybridAlpha: **参数名称:** :guilabel:`sys.hybridAlpha` **默认值:** 当 ``sys.hybridType`` = PBE0 时,默认值为 **0.25** ,当 ``sys.hybridType`` = HSE06 时,默认值为 **0.25** ,当 ``sys.hybridType`` = HSE03 时,默认值为 **0.25** **可选值:** real **描述:** ``sys.hybridAlpha`` 参数指定杂化泛函中精确的交换相关泛函的系数;该参数只有在sys.hybrid = true时生效; **案例:** sys.hybridAlpha = 0.20 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _sys.hybridOmega: **参数名称:** :guilabel:`sys.hybridOmega` **默认值:** 当 ``sys.hybridType`` = PBE0 时,默认值为 **0** ,当 ``sys.hybridType`` = HSE06 时,默认值为 **0.2** ,当 ``sys.hybridType`` = HSE03 时,默认值为 **0.3** **可选值:** real **描述:** ``sys.hybridOmega`` 参数指定杂化泛函的屏蔽系数;该参数只有在sys.hybrid = true时生效; **案例:** sys.hybridOmega = 0.2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.iniCharge: **参数名称:** :guilabel:`cal.iniCharge` **默认值:** 无 **可选值:** 指定rho.bin文件路径 **描述:** ``cal.iniCharge`` 参数表示用户可以通过指定DS-PAW自洽或结构弛豫计算得到的电荷密度文件 **rho.bin** 的路径进行后续的计算; **task=scf/relax** 时,如果不需要读取上一次的电荷密度时则不设置 ``cal.iniCharge`` ,如果需要如果读取上一次的电荷密度时则设置cal.iniCharge; 当task= dos/band/potential/elf时必须设置 ``cal.iniCharge`` 指定 **rho.bin** 的路径;文件路径支持相对路径和绝对路径; **案例:** cal.iniCharge = /home/exp/rho.bin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.iniWave: **参数名称:** :guilabel:`cal.iniWave` **默认值:** 无 **可选值:** 指定wave.bin文件路径 **描述:** ``cal.iniWave`` 参数表示用户可以通过指定DS-PAW自洽或结构弛豫计算得到的波函数文件 **wave.bin** 的路径进行后续的计算;不设置此参数则表示不读取 **wave.bin** ;文件路径支持相对路径和绝对路径; **案例:** cal.iniWave = /home/exp/wave.bin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.cutoffFactor: **参数名称:** :guilabel:`cal.cutoffFactor` **默认值:** 1.0 **可选值:** real **描述:** ``cal.cutoffFactor`` 表示截断能参数cal.cutoff的系数,当 **cal.cutoffFactor=1.5** 时,DS-PAW计算时使用的截断能为cal.cutoff*1.5。DS-PAW2022A版本内部赝势皆已完成测试,cutoffFactor设置默认值1.0已能满足大多计算要求; **案例:** cal.cutoffFactor = 1.0 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.cutoff: **参数名称:** :guilabel:`cal.cutoff` **默认值:** 当前计算所用的元素赝势中截断能的最大值; **可选值:** real **描述:** ``cal.cutoff`` 参数表示DS-PAW软件计算时候使用的平面波基矢的截断能,可在安装路径 **/pseudopotential** 查看各赝势文件内置截断能ecutoff的大小,如从O_PBE.paw文件可读出O_PBE的ecutoff为650 eV。 **案例:** cal.cutoff = 650 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.methods: **参数名称:** :guilabel:`cal.methods` **默认值:** 1 **可选值:** 1/2/3/4/5 **描述:** ``cal.methods`` 表示自洽电子部分优化的方法,1表示 ``BD(block Davidson)`` 方法;2表示 ``RM(residual minimization)`` 方法; 3表示 ``RM(residual minimization)`` 方法和 ``BD(block Davidson)`` 方法的组合;4表示 ``damped MD`` (阻尼分子动力学)方法;5表示 ``conjugated gradient`` (共轭梯度方法);其中4和5可以在杂化泛函中使用; **案例:** cal.methods = 1 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.smearing: **参数名称:** :guilabel:`cal.smearing` **默认值:** 1 **可选值:** 1/2/3/4 **描述:** ``cal.smearing`` 表示用何种方法来设置每个波函数的部分占有数Gaussian smearing/Fermi-smearing/Methfessel-Paxton order 1/tetrahedron method with Blochl corrections; **案例:** cal.smearing = 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.sigma: **参数名称:** :guilabel:`cal.sigma` **默认值:** 0.2 **可选值:** real **描述:** ``cal.sigma`` 表示使用有限温度方法设置部分占有数时的展宽; **案例:** cal.sigma = 0.01 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.kpoints: **参数名称:** :guilabel:`cal.kpoints` **默认值:** [1,1,1] **可选值:** 3*1 int array **描述:** ``cal.kpoints`` 表示DS-PAW设置布里渊区k点网格取样大小; **案例:** cal.kpoints = [9,9,9] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.ksamping: **参数名称:** :guilabel:`cal.ksamping` **默认值:** MP **可选值:** MP/G **描述:** ``cal.ksamping`` 表示DS-PAW自动生成布里渊区k点网格的方法, ``Monkhorst-Pack`` 方法/ ``Gamma centered`` 方法; **案例:** cal.ksamping = G -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _cal.toalBands: **参数名称:** :guilabel:`cal.totalBands` **默认值:** 与体系价电子数目相关 **可选值:** int **描述:** ``cal.totalBands`` 表示DS-PAW计算中所包含的总能带数目; **案例:** cal.totalBands = 100 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.charge: **参数名称:** :guilabel:`io.charge` **默认值:** true **可选值:** true/false **描述:** 输出电荷密度的二进制文件 ``rho.bin`` 和 ``rho.json文件`` ;当io.charge=true时,生成 ``rho.bin`` 和 ``rho.json文件`` ;当task=scf/realx时该参数可以选择 **true/false** ;当task= dos/band/potential/elf时,io.charge强制为 **false** ; **案例:** io.charge = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.elf: **参数名称:** :guilabel:`io.elf` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 输出ELF的数据结果;当task=scf/realx时该参数可以选择 **true/false** ;当task= dos/band/potential时,io.elf强制为 **false** ;当task=elf时,io.elf强制为 **true** ; **案例:** io.elf = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.potential: **参数名称:** :guilabel:`io.potential` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 输出势函数的数据结果;当task=scf/realx时该参数可以选择 **true/false** ;当task= dos/band/elf时,io.potential强制为 **false** ;当task=potential时,io.potential强制为 **true** ;当io.potential=true时,可以选择 ``potential.type`` 来设置输出势函数的类型; **案例:** io.potential = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.wave: **参数名称:** :guilabel:`io.wave` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 输出波函数的二进制文件 ``wave.bin`` ;当io.wave=true时,生成 ``wave.bin`` 文件;当task=scf/realx时该参数可以选择 **true/false** ;当task= dos/band/potential/elf时,io.wave强制为 **false** ; **案例:** io.wave = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.band: **参数名称:** :guilabel:`io.band` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 在task=scf时是否直接计算能带的开关;当io.band=true时,所有能带计算参数都生效; **案例:** io.band = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.dos: **参数名称:** :guilabel:`io.dos` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 在task=scf时是否直接计算态密度的开关;当io.dos=true时,所有态密度计算参数都生效; **案例:** io.dos = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.optical: **参数名称:** :guilabel:`io.optical` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 输出光学性质计算文件optical.json;当io.optical=true时,生成optical.json文件;当task=scf时该参数可以选择true/false; **案例:** io.optical = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.bader: **参数名称:** :guilabel:`io.bader` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 输出bader电荷文件bader.json;当io.bader=true时,生成bader.json文件;当task=scf时该参数可以选择true/false; **案例:** io.bader = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.polarization: **参数名称:** :guilabel:`io.polarization` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 输出铁电极化文件polarization.json;当io.polarization=true时,生成polarization.json文件;当task=scf时该参数可以选择true/false; **案例:** io.polarization = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.magProject: **参数名称:** :guilabel:`io.magProject` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** 在磁矩计算中,控制在system.json文件中是否写入磁矩信息; **案例:** io.magProject = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _io.outStep: **参数名称:** :guilabel:`io.outStep` **默认值:** task = relax/neb 时默认值为1,task = aimd 时默认值为20 **可选值:** int **描述:** 控制在结构弛豫计算、过渡态计算、分子动力学模拟计算中,多少个离子步在对应的paw_tmp/relax.tmp、paw_tmp/neb.tmp、paw_tmp/aimd.tmp文件中写一次结构信息; **案例:** io.outStep = 50 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _scf.max: **参数名称:** :guilabel:`scf.max` **默认值:** 60 **可选值:** int **描述:** ``scf.max`` 表示DS-PAW自洽计算时电子步的最大步数; **案例:** scf.max = 100 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _scf.min: **参数名称:** :guilabel:`scf.min` **默认值:** 2 **可选值:** int **描述:** ``scf.min`` 表示DS-PAW自洽计算时电子步的最少步数; **案例:** scf.min = 5 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _scf.mixBeta: **参数名称:** :guilabel:`scf.mixBeta` **默认值:** 0.4 **可选值:** real **描述:** ``scf.mixBeta`` 表示DS-PAW自洽计算时电子混合算法的Beta值; **案例:** scf.mixBeta = 0.2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _scf.mixType: **参数名称:** :guilabel:`scf.mixType` **默认值:** Broyden **可选值:** Broyden/Kerker **描述:** ``scf.mixType`` 表示DS-PAW自洽计算时电子混合算法的类型,目前支持 **Broyden方法** 和 **Kerker方法** ; **案例:** scf.mixType = Broyden -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _scf.convergence: **参数名称:** :guilabel:`scf.convergence` **默认值:** 1.0e-4 **可选值:** real **描述:** ``scf.convergence`` 表示DS-PAW自洽计算时,能量的收敛判据; **案例:** scf.convergence = 1.0e-5 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _relax.max: **参数名称:** :guilabel:`relax.max` **默认值:** 60 **可选值:** int **描述:** ``relax.max`` 表示DS-PAW结构驰豫时,最大的离子步步数; **案例:** relax.max = 300 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _relax.freedom: **参数名称:** :guilabel:`relax.freedom` **默认值:** atom **可选值:** atom/all/volume **描述:** ``relax.freedom`` 表示DS-PAW结构驰豫的自由度,atom表示只弛豫原子; all表示弛豫晶格常数和原子; volume表示只弛豫晶格; **案例:** relax.freedom = atom -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _relax.methods: **参数名称:** :guilabel:`relax.methods` **默认值:** CG **可选值:** CG/DMD/QN **描述:** ``relax.methods`` 表示DS-PAW结构驰豫的方法,CG表示共轭梯度法; DMD表示阻尼分子动力学法; QN表示准牛顿方法; **案例:** relax.methods = CG -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _relax.convergenceType: **参数名称:** :guilabel:`relax.convergenceType` **默认值:** force **可选值:** force/energy **描述:** ``relax.convergenceType`` 表示弛豫计算中收敛标准的选择,可以选择受力或以能量为收敛标准; **案例:** relax.convergenceType = energy -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _relax.convergence: **参数名称:** :guilabel:`relax.convergence` **默认值:** 0.05/1e-4 **可选值:** real **描述:** ``relax.convergence`` 表示DS-PAW结构驰豫时,原子受力或能量的收敛判据;选择力为收敛标准时默认值为0.05,选择能量为收敛标准时默认值为1e-4; **案例:** relax.convergence = 0.01 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _relax.stepRange: **参数名称:** :guilabel:`relax.stepRange` **默认值:** 0.5 **可选值:** real **描述:** ``relax.stepRange`` 表示结构驰豫时,结构驰豫的中的缩放常数; **案例:** relax.stepRange = 0.2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _dos.range: **参数名称:** :guilabel:`dos.range` **默认值:** [-10,10] **可选值:** 2*1 array **描述:** ``dos.range`` 表示当task=dos时,态密度计算能量的区间; **案例:** dos.range = [-15,15] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _dos.resolution: **参数名称:** :guilabel:`dos.resolution` **默认值:** 0.05 **可选值:** real **描述:** ``dos.resolution`` 表示当task=dos时,态密度计算能量间隔精度; **案例:** dos.resolution = 0.1 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _dos.project: **参数名称:** :guilabel:`dos.project` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``dos.project`` 参数控制着投影态密度;当task=dos时,dos.project为 **false/true** ;若打开投影,dos.project= ture , 此时 ``dos.json`` 中将会保存投影态密度的信息;若不打开投影,dos.project = false ; **案例:** dos.project = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _dos.EfShift: **参数名称:** :guilabel:`dos.EfShift` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``dos.EfShift`` 参数表示 ``dos.range`` 的两个能量是否按照自洽的费米能级平移;当dos.EfShift=fasle,则 ``dos.range`` 的能量不按照费米能级平移;当dos.EfShift=true,则 ``dos.range`` 的能量按照费米能级平移; **案例:** dos.EfShift = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _band.kpointsLabel: **参数名称:** :guilabel:`band.kpointsLabel` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 string array **描述:** 该参数只有在task=band时才能生效; ``band.kpointsLabel`` 为能带计算时高对称点标签, band.kpointsLabel数据大小是band.kpointsCoord 数据大小的 **1/3** ;比band.kpointsNumber数据大小多 **1** ; **案例:** band.kpointsLabel = [G,M,K,G] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _band.kpointsCoord: **参数名称:** :guilabel:`band.kpointsCoord` **默认值:** 无 **可选值:** 3n*1 real array **描述:** 该参数只有在task=band时才能生效; **band.kpointsCoord** 为能带计算时高对称点的分数坐标, band.kpointsCoord 数据大小是band.kpointsLabel数据大小的 **3倍** ; **案例:** band.kpointsCoord = [0, 0, 0, 0.5, 0.5, 0.5, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _band.kpointsNumber: **参数名称:** :guilabel:`band.kpointsNumber` **默认值:** 无 **可选值:** (n-1)*1 int array **描述:** 该参数只有在task=band时才能生效; **band.kpointsNumber** 为能带每相邻两个高对称点的间隔, ``band.kpointsNumber`` 比 ``band.kpointsLabel`` 数据大小少 **1** ; **案例:** band.kpointsNumber = [5, 5, 5] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _band.project: **参数名称:** :guilabel:`band.project` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``band.project`` 参数控制着投影能带;当task= band 时, band.project为 **false/true** ;若打开投影,band.project= ture , 此时 ``band.json`` 中将会保存投影态密度的信息;若不打开投影,band.project = false ; **案例:** band.project = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _band.unfolding: **参数名称:** :guilabel:`band.unfolding` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``band.unfolding`` 参数是能带去折叠的开关;当task= band 时, band.unfolding生效(io.band = true不生效),若设置band.unfolding= ture , 此时 ``band.json`` 中将会保存反折叠能带数据 ; **案例:** task = band, band.unfolding = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _band.primitiveUVW: **参数名称:** :guilabel:`band.primitiveUVW` **默认值:** 无 **可选值:** 9*1 real array **描述:** ``band.primitiveUVW`` 能带去折叠计算时,超胞的晶格常数乘上UVW系数等于原胞的晶格矢量; **案例:** band.primitiveUVW = [0.0, 0.5, 0.5, 0.5, 0.0, 0.5, 0.5, 0.5, 0.0] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _potential.type: **参数名称:** :guilabel:`potential.type` **默认值:** total **可选值:** total/hartree/all **描述:** ``potential.type`` 只在task=scf/realx且io.potential=true、或task=potential时生效;当potential.type为hartree时, ``potental.json`` 中输出静电势,当为total时,potental.json中输出总的局域势即离子势、静电势和交换关联势的和,当为all时, ``potental.json`` 中同时输出两个势; **案例:** potential.type = all -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.chargedSystem: **参数名称:** :guilabel:`corr.chargedSystem` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``corr.chargedSystem`` 表示当计算带电体系时,可以设置该参数修正带电块体体系的能量; **案例:** corr.chargedSystem = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dipol: **参数名称:** :guilabel:`corr.dipol` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``corr.dipol`` 表示引入人为的势场(偶极修正)来修正真空电势不平整的问题; **案例:** corr.dipol = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dipolDirection: **参数名称:** :guilabel:`corr.dipolDirection` **默认值:** 无 **可选值:** a/b/c **描述:** ``corr.dipolDirection`` 表示偶极修正的方向,a/b/c分别表示三个晶格常数的方向; **案例:** corr.dipolDirection = c -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dipolPosition: **参数名称:** :guilabel:`corr.dipolPosition` **默认值:** 无 **可选值:** 3*1 real array **描述:** ``corr.dipolPosition`` 表示偶极子在晶胞的相对位置; **案例:** corr.dipolPosition = [0.5, 0.5, 0.5] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dipolEfield: **参数名称:** :guilabel:`corr.dipolEfield` **默认值:** 0 **可选值:** real **描述:** ``corr.dipolEfield`` 表示外加电场的大小,单位为eV/Å,该参数只在 ``corr.dipol = true`` 和设置 ``corr.dipolDirection`` 的情况下生效; **案例:** corr.dipolEfield = 0.05 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dftu: **参数名称:** :guilabel:`corr.dftu` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``corr.dftu`` 表示是否引入hubbard U来处理强关联体系; **案例:** corr.dftu = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dftuElements: **参数名称:** :guilabel:`corr.dftuElements` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 string array **描述:** ``corr.dftuElements`` 表示设置需要加U的元素; **案例:** corr.dftuElements = [Ni,O] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dftuOrbital: **参数名称:** :guilabel:`corr.dftuOrbital` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 string array **描述:** ``corr.dftuOrbital`` 表示设置选中元素上需要加U的轨道; **案例:** corr.dftuOrbital = [d,s] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dftuU: **参数名称:** :guilabel:`corr.dftuU` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 real array **描述:** ``corr.dftuU`` 表示设置选中元素选中轨道上需要加U值的大小; **案例:** corr.dftuU = [8,1] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.dftuJ: **参数名称:** :guilabel:`corr.dftuJ` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 real array **描述:** ``corr.dftuJ`` 表示设置选中元素选中轨道上需要加J值的大小; **案例:** corr.dftuJ = [0.95,0] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.VDW: **参数名称:** :guilabel:`corr.VDW` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``corr.VDW`` 表示是否引入范德瓦尔斯修正; **案例:** corr.VDW = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _corr.VDWType: **参数名称:** :guilabel:`corr.VDWType` **默认值:** D2G **可选值:** D2G/D3G/D3BJ **描述:** ``corr.VDWType`` 表示使用哪种范德瓦尔斯修正,D2G表示DFT-D2 of Grimme方法; D3G表示DFT-D3 of Grimme方法; D3BJ表示DFT-D3 with Becke-Jonson damping方法; **案例:** corr.VDWType = D3G -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _pcharge.bandIndex: **参数名称:** :guilabel:`pcharge.bandIndex` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 int array **描述:** ``pcharge.bandIndex`` 表示部分电荷密度计算时能带的序号; **案例:** pcharge.bandIndex = [1,3,4] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _pcharge.kpointsIndex: **参数名称:** :guilabel:`pcharge.kpointsIndex` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 int array **描述:** ``pcharge.kpointsIndex`` 表示部分电荷密度计算时K点的序号; **案例:** pcharge.kpointsIndex = [12,14] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _pcharge.sumK: **参数名称:** :guilabel:`pcharge.sumK` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``pcharge.sumK`` 表示计算部分电荷密度之后保存数据是否将所有K点,不同能带的数据相加; **案例:** pcharge.sumK = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.springK: **参数名称:** :guilabel:`neb.springK` **默认值:** 5 **可选值:** real **描述:** ``neb.springK`` 表示过渡态计算中弹簧系数K; **案例:** neb.springK = 7 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.images: **参数名称:** :guilabel:`neb.images` **默认值:** 无 **可选值:** int **描述:** ``neb.images`` 表示过渡态计算中的中间结构的数目; **案例:** neb.images = 5 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.iniFin: **参数名称:** :guilabel:`neb.iniFin` **默认值:** false **可选值:** true/false **描述:** ``neb.iniFin`` 表示过渡态计算中初态结构和末态结构是否进行自洽计算,true表示进行自洽计算; **案例:** neb.iniFin = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.method: **参数名称:** :guilabel:`neb.method` **默认值:** QN **可选值:** LBFGS/CG/QM/QN/QM2/FIRE **描述:** ``neb.method`` 表示过渡态计算中使用的算法; **案例:** neb.method = QN -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.freedom: **参数名称:** :guilabel:`neb.freedom` **默认值:** atom **可选值:** atom/all **描述:** ``neb.freedom`` 表示过渡态计算中弛豫的自由度,可以选择只弛豫原子,也可放开晶胞进行弛豫; **案例:** neb.freedom = all -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.convergenceType: **参数名称:** :guilabel:`neb.convergenceType` **默认值:** force **可选值:** force/energy **描述:** ``neb.convergenceType`` 表示过渡态计算中收敛标准的选择,可以选择受力或以能量为收敛标准; **案例:** neb.convergenceType = energy -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.convergence: **参数名称:** :guilabel:`neb.convergence` **默认值:** 0.1/1e-4 **可选值:** real **描述:** ``neb.convergence`` 表示过渡态计算中受力或能量的收敛标准;选择力为收敛标准时默认值为0.1,选择能量为收敛标准时默认值为1e-4; **案例:** neb.convergence = 0.01 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.stepRange: **参数名称:** :guilabel:`neb.stepRange` **默认值:** 0.1 **可选值:** int **描述:** ``neb.stepRange`` 表示过渡态计算中结构弛豫的步长; **案例:** neb.stepRange = 0.01 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _neb.max: **参数名称:** :guilabel:`neb.max` **默认值:** 60 **可选值:** int **描述:** ``neb.max`` 表示过渡态计算中结构弛豫的最大步数; **案例:** neb.max = 300 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _frequency.dispOrder: **参数名称:** :guilabel:`frequency.dispOrder` **默认值:** 1 **可选值:** 1/2 **描述:** ``frequency.dispOrder`` 表示频率计算时原子振动的方式,1对应中心差分法,有两种振动方式,2对应四种振动方式; **案例:** frequency.dispOrder = 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _frequency.dispRange: **参数名称:** :guilabel:`frequency.dispRange` **默认值:** 0.01 **可选值:** real **描述:** ``frequency.dispRange`` 表示频率计算时的原子位移; **案例:** frequency.dispRange = 0.05 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.structureSize: **参数名称:** :guilabel:`phonon.structureSize` **默认值:** [1,1,1] **可选值:** 3*1 int array **描述:** ``phonon.structureSize`` 表示声子计算时超胞的大小; **案例:** phonon.structureSize = [2,2,2] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.method: **参数名称:** :guilabel:`phonon.method` **默认值:** fd **可选值:** fd/dfpt **描述:** ``phonon.method`` 表示声子计算的方式;fd为有限位移法;dfpt为密度泛函微扰理论方法; **案例:** phonon.method = dfpt -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.type: **参数名称:** :guilabel:`phonon.type` **默认值:** phonon **可选值:** phonon/band/dos/bandDos **描述:** ``phonon.type`` 表示声子计算哪些性质:phonon对应计算力常数矩阵或force set;band对应计算声子能带;dos对应计算声子态密度;bandDos对应计算声子能带及声子态密度; **案例:** phonon.type = bandDos -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.isDisplacement: **参数名称:** :guilabel:`phonon.isDisplacement` **默认值:** true **可选值:** true/false **描述:** ``phonon.isDisplacement`` 表示fd方法计算声子计算时是否进行位移; **案例:** phonon.isDisplacement = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.fdDisplacement: **参数名称:** :guilabel:`phonon.fdDisplacement` **默认值:** 0.01 **可选值:** real **描述:** ``phonon.fdDisplacement`` 表示fd方法计算声子计算时进行位移的大小; **案例:** phonon.fdDisplacement = 0.05 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.iniPhonon: **参数名称:** :guilabel:`phonon.iniPhonon` **默认值:** 无 **可选值:** 指定phonon.json的路径 **描述:** ``phonon.iniPhonon`` 表示声子能带或态密度计算时读取力常数矩阵或force set时的路径; **案例:** phonon.iniPhonon = ./phonon.json -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.qsamping: **参数名称:** :guilabel:`phonon.qsamping` **默认值:** MP **可选值:** MP/G **描述:** ``phonon.qsamping`` 表示计算声子时布里渊区q点采样方法,``Monkhorst-Pack`` 方法/ ``Gamma centered`` 方法; **案例:** phonon.qsamping = G -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.qpoints: **参数名称:** :guilabel:`phonon.qpoints` **默认值:** [1,1,1] **可选值:** 3*1 int array **描述:** ``phonon.qpoints`` 表示声子计算时Q空间网格取样大小; **案例:** phonon.qpoints = [9,9,9] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.qpointsLabel: **参数名称:** :guilabel:`phonon.qpointsLabel` **默认值:** 无 **可选值:** n*1 string array **描述:** ``phonon.qpointsLabel`` 表示声子能带计算时高对称点标签; **案例:** phonon.qpointsLabel = [G,M,K,G] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.qpointsCoord: **参数名称:** :guilabel:`phonon.qpointsCoord` **默认值:** 无 **可选值:** 3n*1 real array **描述:** ``phonon.qpointsCoord`` 表示声子能带计算时高对称点坐标; **案例:** phonon.qpointsCoord = [0, 0, 0, 0.5, 0.5, 0.5, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.qpointsNumber: **参数名称:** :guilabel:`phonon.qpointsNumber` **默认值:** 51 **可选值:** int **描述:** ``phonon.qpointsNumber`` 表示声子能带相邻两个高对称点的间隔; **案例:** phonon.qpointsNumber = 100 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.primitiveUVW: **参数名称:** :guilabel:`phonon.primitiveUVW` **默认值:** [1,0,0,0,1,0,0,0,1] **可选值:** 9*1 real array **描述:** ``phonon.primitiveUVW`` 声子能带计算时,超胞的晶格常数乘上UVW系数等于原胞的晶格矢量; **案例:** phonon.primitiveUVW = [1,0,0,0,1,0,0,0,1] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.dosRange: **参数名称:** :guilabel:`phonon.dosRange` **默认值:** [0, 40] **可选值:** 2*1 real array **描述:** ``phonon.dosRange`` 表示声子态密度计算能量的区间; **案例:** phonon.dosRange = [-15,15] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.dosResolution: **参数名称:** :guilabel:`phonon.dosResolution` **默认值:** 0.1 **可选值:** real **描述:** ``phonon.dosResolution`` 表示声子态密度计算能量间隔精度; **案例:** phonon.dosResolution = 0.01 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.dosSigma: **参数名称:** :guilabel:`phonon.dosSigma` **默认值:** 0.1 **可选值:** real **描述:** ``phonon.dosSigma`` 表示声子态密度计算时的展宽; **案例:** phonon.dosSigma = 0.1 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.dfptEpsilon: **参数名称:** :guilabel:`phonon.dfptEpsilon` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``phonon.dfptEpsilon`` 是phonon.method = dfpt时控制介电常数计算的开关; **案例:** phonon.dfptEpsilon = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.nac: **参数名称:** :guilabel:`phonon.nac` **默认值:** phonon.dfptEpsilon = true 时默认为true **可选值:** false/true **描述:** 当phonon.dfptEpsilon = true时,若计算能带和态密度,phonon.nac作为是否使用non-analytical term correction的开关; **案例:** phonon.nac = false -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.thermal: **参数名称:** :guilabel:`phonon.thermal` **默认值:** false **可选值:** false/true **描述:** ``phonon.thermal`` 是 task=phonon且phonon.type=dos或phonon.type=bandDos时控制热力学性质计算的开关; **案例:** phonon.thermal = true -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _phonon.thermalRange: **参数名称:** :guilabel:`phonon.thermalRange` **默认值:** [0,1200,10] **可选值:** 3*1 real array **描述:** ``phonon.thermalRange`` [min_T, max_T, ΔT]表示热力学性质计算时温度的选取范围以及数据存储间隔; **案例:** phonon.thermalRange = [0,1000,10] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _elastic.dispOrder: **参数名称:** :guilabel:`elastic.dispOrder` **默认值:** 1 **可选值:** 1/2 **描述:** ``elastic.dispOrder`` 表示弹性常数计算时原子振动的方式,1对应中心差分法,有两种振动方式,2对应四种振动方式; **案例:** elastic.dispOrder = 1 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _elastic.dispRange: **参数名称:** :guilabel:`elastic.dispRange` **默认值:** 0.01 **可选值:** real **描述:** ``elastic.dispRange`` 表示弹性常数计算时的原子位移; **案例:** elastic.dispRange = 0.05 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _aimd.ensemble: **参数名称:** :guilabel:`aimd.ensemble` **默认值:** NVE **可选值:** NVE/NVT/TS **描述:** ``aimd.ensemble`` 表示分子动力学模拟时选用的系综;TS对应高温退火过程; **案例:** aimd.ensemble = NVE -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _aimd.thermostat: **参数名称:** :guilabel:`aimd.thermostat` **默认值:** none **可选值:** none/andersen/noseHoover **描述:** ``aimd.thermostat`` 表示分子动力学模拟时选用的热浴方法; **案例:** aimd.thermostat = andersen -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _aimd.iniTemp: **参数名称:** :guilabel:`aimd.iniTemp` **默认值:** 无 **可选值:** real **描述:** ``aimd.iniTemp`` 表示分子动力学模拟时的初始温度; **案例:** aimd.iniTemp = 1000 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _aimd.finTemp: **参数名称:** :guilabel:`aimd.finTemp` **默认值:** aimd.iniTemp **可选值:** real **描述:** ``aimd.finTemp`` 表示分子动力学模拟时的末态温度; **案例:** aimd.finTemp = 1000 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _aimd.timeStep: **参数名称:** :guilabel:`aimd.timeStep` **默认值:** 无 **可选值:** real **描述:** ``aimd.timeStep`` 表示分子动力学模拟时的时间步长; **案例:** aimd.timeStep = 1 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- .. _aimd.totalSteps: **参数名称:** :guilabel:`aimd.totalSteps` **默认值:** 无 **可选值:** real **描述:** ``aimd.totalSteps`` 表示分子动力学模拟的总步数; **案例:** aimd.totalSteps = 10000 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------